Juri Beretta
Trieste,TS
Profilo professionale
Bioinformatico con background in Genomica Funzionale, specializzato in analisi di dati genomici e sviluppo di pipeline computazionali. Competente in Python, R, Linux, Snakemake e nei principali tool per assemblaggio, allineamento, quality control e analisi di popolazione. Esperienza consolidata in ambito accademico, sia nella ricerca che nella didattica. Autonomo, organizzato e orientato alla qualità del dato.
Panoramica
3
3
years of professional experience
1
1
Certification
Esperienza lavorativa
Studente Tirocinante
Università degli Studi di Trieste
Trieste, TS
02.2025 - 02.2026
- Area di ricerca: Genomica Applicata e Comparata
- Attività: Studio della genetica di popolazione di Littorina saxatilis con tecniche di genomica computazionale.
- Settore: Genomica e Biologia ambientale
- Principali attività e responsabilità: Analisi di dati di re-sequencing di Littorina saxatilis per la costruzione del pangenoma della specie e analisi di genetica di popolazione. Aggiornamento della pipeline RePaRe per riassemblaggio di genomi di organismi diploidi
- Competenze e obiettivi raggiunti: Competenze in gestione di sistemi informatici linux based, programmazione in python, R. Gestione e utilizzo di text based generative AI. Competenze estese nel utilizzo di tool bioinformatici
Studente Tirocinante
Università degli Studi di Trieste
TRIESTE, TS
10.2022 - 03.2023
- Area di ricerca: Genomica applicata e comparata
- Attività: Tirocinio presso laboratorio di bioinformatica del Dipartimento di Scienze della Vita.
- Settore: Genomica e Biologia ambientale
- Principali attività e responsabilità: Studio di genomi di platelminti con Modelli Marcoviani Nascosti (HMM) per la ricerca di presunti peptidi antimicrobici e costruzione di conseguente albero filogenetico dei peptidi trovati.
- Competenze e obiettivi raggiunti: Conoscenza base di strumenti di analisi bioinformatica di dati di sequenza. Utilizzo di computer, programmi per analisi bioinformatica di dati di sequenza e rudimenti di gestione di sistemi Linux Based. Gestione di dati di sequenza.
Tutor del corso di Genomica funzionale
Università degli Studi di Trieste
TRIESTE, TS
01.2025 - 12.2025
- Area: risorse umane, formazione
- Attività: Attività di tutorato a supporto degli studenti del Corso di Laurea Magistrale
- Principali attività e responsabilità: Supporto ai futuri studenti e agli studenti già iscritti nel navigare questioni burocratiche al interno dell'università. Supporto per problemi tecnici con esami, tirocini, richiesta di laurea etc..
- Inoltre, supportare e organizzare il International workshop in Gene Expression, Corso intensivo annuale organizzato nel ambito del corso Magistrale in Genomica Funzionale in collaborazione con il progetto di Double Degree.
Tutor alla didattica Digitale
Università degli Studi di Trieste
TRIESTE, TS
01.2024 - 12.2024
- Area: risorse umane
- Attività: supporto informatico alla didattica nel corso di laurea triennale in Scienze e Tecnologie Biologiche
- Principali attività e responsabilità: Aiuto ai professori del corso di studi Scienze e Tecnologie Biologiche per la preparazione di lezioni, esami, quiz etc. in forma digitale
Tutor di Laboratorio Didattico di Microbiologia
Università degli Studi i Trieste
Trieste, TS
10.2025 - 12.2025
Supporto alla professoressa durante lo svolgimento delle attività di laboratorio e nella valutazione delle relazioni di laboratorio prodotte dai gruppi di studenti.
Istruzione
Corso di Laurea Magistrale - Genomica Funzionale
Università degli Studi di TRIESTE
TRIESTELaurea - Scienze e Tecnologie biologiche
Università degli Studi di TRIESTE
TRIESTE01.2023
Diploma di Maturià Scientifica - italiano
IIS Niccolò Machiavelli
Pioltello01.2021
Competenze
Competenze Tecniche in Bioinformatica e Analisi Genomica Strumenti Bioinformatici
Competenze in analisi e gestione di dati genomici:
Esperienza specifica nello studio di variazioni strutturali genomiche mediante pipeline dedicate e integrazione di dati PacBio HiFi e Bionano
Allineamento e manipolazione di sequenze
- BWA, BWA-MEM, BWA-MEM2, Samtools
Preprocessing delle letture
- Cutadapt, Fastp
Assemblaggio genomico, polishing e analisi k-mer
- Hifiasm, Meryl, GenomeScope2, Merqury, gfastats
Rilevamento di varianti strutturali e PAV
- Bionano, purge_dups, SALSA2
Annotazione genomica
- BRAKER, BUSCO
Genomica di popolazione e analisi statistiche
- PLINK, GEMMA, STRUCTURE
Acceleratori e ottimizzazioni GPU
- Clara Genomics Parabricks
Clustering e riduzione della ridondanza
- CD-HIT
Valutazione della qualità dell'assemblaggio
- QUAST
Workflow management
- Snakemake
Competenze informatiche:
- Elaborazione testi: (Avanzato) Fogli elettronici: (Intermedio) Software di presentazione: (Avanzato) Suite da ufficio: (Avanzato) Web Browser: (Avanzato)
Linguaggi di programmazione:
- Linguaggi di Programmazione: R, Python, C, Bash (Base)
Gestioni di sistemi operativi: Windows, Linux (Avanzato)
Gestione Dati:
- Sistemi di gestione di database (DBMS): (Intermedio)
Altre Competenze:
- Predisposizione all'apprendimento
- Spirito di collaborazione
- Capacità di lavorare per obiettivi
- Capacità organizzative
- Teamworking
- Comunicazione e Collaborazione
- Creazione di contenuti digitali
- Sicurezza Digitale
- Problem Solving
COMPETENZE LINGUISTICHE
Lingua madre: Italiano
Esperto
C2
Inglese
Esperto
C2
COMPETENZE
- Competenze comunicative
- Dal 2008 faccio parte del movimento scout internazionale, in particolare, nell'associazione CNGEI (Corpo Nazionale Giovani Esploratori ed Esploratrici Italiani). dal 2018 sono educatore di ragazzi nella associazione.
- La necessità di collaborare con molte altre persone, anche sconosciuti, mi ha permesso di sviluppare buone capacità comunicative e la capacità di lavorare in gruppi molto diversificati.
- Competenze organizzative e gestionali
- Dal 2008 faccio parte del movimento scout internazionale, in particolare, nell'associazione CNGEI (Corpo Nazionale Giovani Esploratori ed Esploratrici Italiani). dal 2018 sono educatore di ragazzi nella associazione. Dal 2022 sono responsabile di un gruppo di educatori come me che svolgono attività di volontariato. grazie a questa esperienza ho sviluppato buone capacità di gestione di risorse, di risoluzione di conflitti. Ho buone capacità nella organizzazione di eventi e sono una persona organizzata nel lavoro.
Hobby e interessi
Dal 2008 faccio parte del movimento scout internazionale, in particolare, nell'associazione CNGEI (Corpo Nazionale Giovani Esploratori ed Esploratrici Italiani) Dal 2018 sono educatore di ragazzi nella associazione Dal 2022 sono responsabile di un gruppo di educatori come me che svolgono attività di volontariato grazie a questa esperienza ho sviluppato buone capacità di leadership, di risoluzione dei conflitti Ho buone capacità nella organizzazione di eventi e sono una persona organizzata nel lavoro
Certificazioni
Partecipazione al International Workshop in Gene Expression 2024
Partecipazione a IMAP 2023 (International Meeting on Antimicrobial Peptides) - Partecipazione e Supporto Tecnico informatico
Cronologia
Tutor di Laboratorio Didattico di Microbiologia
Università degli Studi i Trieste
10.2025 - 12.2025
Studente Tirocinante
Università degli Studi di Trieste
02.2025 - 02.2026
Tutor del corso di Genomica funzionale
Università degli Studi di Trieste
01.2025 - 12.2025
Tutor alla didattica Digitale
Università degli Studi di Trieste
01.2024 - 12.2024
Studente Tirocinante
Università degli Studi di Trieste
10.2022 - 03.2023
Corso di Laurea Magistrale - Genomica Funzionale
Università degli Studi di TRIESTE
Laurea - Scienze e Tecnologie biologiche
Università degli Studi di TRIESTE
Diploma di Maturià Scientifica - italiano
IIS Niccolò Machiavelli